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FICHE EXAMEN
MÉTAGÉNOMIQUE DIAGNOSTIQUE
Révisé le 25/03/2024 16:26:35
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EXAMEN
Nom de l'examenMÉTAGÉNOMIQUE DIAGNOSTIQUE
Renseignements cliniques et biologiquesoui, fortement recommandés
SynonymesNGS
IDENTIFICATION PAN PATHOGÈNE (BACTÉRIES, VIRUS, CHAMPIGNONS, PARASITES)
Feuille de demande requiseFeuille de demande MICROBIOLOGIE NGS ("META" version de l'année en cours)
Laboratoire exécutant
MONDOR PLATEFORME GENOMIQUE
Formulaire requis
Préparation du patient avant prélèvementnon
Fréquence de réalisation du testHebdomadaire
Sont pris en charge dans la série de la semaine les échantillons arrivant avant le mardi 10h.
Consignes particulièresContacts pour renseignements biologiques
Pr Christophe Rodriguez : DECT 36485 ou 01.49.81.28.33
Dr. Pierre Cappy : 01.49.81.29.85
Dr Paul-Louis Woerther : 01.49.81.39.84
Dr. Cécile Angebault : 01.49.81.49.37
microbiologie.genobiomics.hmn@aphp.mssante.fr
Renseignements thérapeutiquesoui, fortement recommandés
Code informatiqueE356
ANALYTIQUE
Technique analytiqueSéquençage à haut débit
Délais de rajout de l'examenNA
POST ANALYTIQUE
Délai de rendu des résultat (à partir de la réception de l'échantillon au laboratoire)3 semaines
Délai de rendu de résultats en urgence10 jours
En cas d'urgence, les échantillons doivent nous parvenir avant le mardi 10h pour être pris en charge dans la série de la semaine.
Délai de conservation en biothèque2 ans
PRÉ ANALYTIQUE
Types d'échantillon / Milieux de prélèvementTous types de prélèvements (à discuter avec le biologiste)
Quantité à prélever, détails particuliers400uL pour les prélèvements liquides
20mg pour les biopsies
Récipient à prélever
x1Tube EDTA K2 ou K3
x1Flacon stérile à bouchon rouge
x1Tube gradué stérile pour LCR
x1Ecouvillon avec ou sans milieux de transport
x1Tube avec gel séparateur
x1Tube stérile à bouchon rouge
x1Flacon en polypropylène
x1Ecouvillon UMT + Tube COPAN
x1pot à billes
x1Feuille de demande Microbiologie NGS
TRANSPORT / CONSERVATION
Condition d'acheminement (délai, température)Pour HUHM : A acheminer à température ambiante pour les échantillons primaire prélevés dans la journée. En cas de délais entre le prélèvement et l'acheminement, conserver l'échantillons à +4C.
Pour les hôpitaux extérieurs : à acheminer en maximum 7 jours à +4C ou congelé pour les échantillons primaires / sans délais imposé et à température ambiante pour les blocs paraffine ou les lames d'anatomo-pathologie.
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